Pracami WRDS kieruje prezydium WRDS, w skład którego wchodzi Przewodniczący WRDS i wszyscy Wiceprzewodniczący WRDS. Zgodnie z Ustawą z dnia 24 lipca 2015 r. o Radzie Dialogu Społecznego i innych instytucjach dialogu społecznego (Dz. U. z 2015 r., poz. 1240), członkami prezydium ze strony samorządowej jest Marszałek Województwa Pomorskiego, a ze strony rządowej Wojewoda Pomorski. Każda z reprezentatywnych organizacji związkowych oraz reprezentatywnych organizacji pracodawców wskazuje po jednym Wiceprzewodniczącym WRDS.

Skład Prezydium Wojewódzkiej Rady Dialogu Społecznego:

1. Beata Rutkiewicz – Wojewoda Pomorska;
2. Adam Liszczewski  – Ogólnopolskie Porozumienie Związków Zawodowych;
3. Stanisław Taube – Forum Związków Zawodowych – Przewodniczący Wojewódzkiej Rady Dialogu Społecznego w Gdańsku;
4. Roman Kuzimski – Niezależny Samorządny Związek Zawodowy „Solidarność”;
5. Zbigniew Canowiecki – Konfederacja Lewiatan
6. Maciej Dobrzyniecki – Związek Pracodawców Business Centre Club;
7. Jolanta Szydłowska – Pracodawcy Rzeczypospolitej Polskiej;
8. Tadeusz Zdunek – Związek Rzemiosła Polskiego;
9. Artur Kowalczyk – Federacja Przedsiębiorców Polskich;
10. Mieczysław Struk – Marszałek Województwa Pomorskiego.